时代乃是2013年 现代。 笼罩在名为“生物兵器”的次世代恐怖犯罪者的威胁下、所谓的安全神话崩坏殆尽后的日本。 至今都一直过着平和的普通生活的主人公・那智祐爾 (なち ゆうじ)于那一日、陷入了毫无道理的死亡危机之中。
但、就在死神的脚步逼近耳边之时、于那智祐爾身前出现的乃是、与手中所持散发着凛凛寒光的漆黑枪械、丝毫不合的少女。
「此时此刻如果你决心拒绝了名为 “死” 的命运的话…… 我们将会全力保护你」
于是、少年获知了“世界的另一边” 生物兵器的恐怖袭击、她们于此战斗的理由、以及她们与主人公所持有的名为“特异点”的异能……。 内心涌动着名为决意的感情、那智祐爾选择了、踏上了、与少女们一同、投身于战斗了――